The 16S ribosomal RNA mutation database (16SMDB)
نویسنده
چکیده
The 16S ribosomal RNA mutation database (16SMDB) provides a list of mutated positions in 16S ribosomal RNA from Escherichia coli and the identity of each alteration. Information provided for each mutation includes: (i) a brief description of the phenotype(s) associated with each mutation; (ii) whether a mutant phenotype has been detected by in vivo or in vitro methods; (iii) relevant literature citations. The database is available via ftp and on the World Wide Web.
منابع مشابه
Expansion of the 16S and 23S Ribosomal RNA Mutation Databases
The Ribosomal RNA Mutation Databases (16SMDB and 23SMDB) provide lists of mutated positions in 16S and 23S ribosomal RNA from Escherichia coli and the identity of each alteration. Information provided for each mutation includes: (i) a brief description of the phenotype(s) associated with each mutation; (ii) whether a mutant phenotype has been detected by in vivo or in vitro methods; and (iii) r...
متن کاملExpanded versions of the 16S and 23S ribosomal RNA mutation databases (16SMDBexp and 23SMDBexp) [published erratum appears in Nucleic Acids Res 1998 Feb 15;26(4): following 1134]
Expanded versions of the Ribosomal RNA Mutation Databases provide lists of mutated positions in 16S and 16S-like ribosomal RNA (16SMDBexp) and 23S and 23S-like ribosomal RNA (23SMDBexp) and the identity of each alteration. Alterations from organisms other than Escherichia coli are reported at positions according to the E.coli numbering system. Information provided for each mutation includes: (i...
متن کاملشناسایی انتروباکتر ساکازاکی در نوزادان مبتلا به سپسیس با استفاده از PCR بر روی ژن 16S ribosomal RNA
زمینه: انتروباکتر ساکازاکی باسیلی گرم منفی، بیهوازی اختیاری و متعلق به خانواه انتروباکتریاسیه است که بهعنوان پاتوژن فرصتطلب مهم مطرح و سبب بیماریهای مختلف از جمله سپسیس، مننژیت، انتروکولیت نکروزان و باکتریمی در نوزادان میگردد. هدف از این بررسی شناسایی انتروباکتر ساکازاکی در نوزادان مبتلا به سپسیس با استفاده از PCR بر روی ژن 16S ribosomal RNA بود. مواد و روشها: این مطالعه مقطعی طی شهریور 1...
متن کاملTaxCollector: Modifying Current 16S rRNA Databases for the Rapid Classification at Six Taxonomic Levels
The high level of conservation of 16S ribosomal RNA gene (16S rRNA) in all Prokaryotes makes this gene an ideal tool for the rapid identification and classification of these microorganisms. Databases such as the Ribosomal Database Project II (RDP-II) and the Greengenes Project offer access to sets of ribosomal RNA sequence databases useful in identification of microbes in a culture-independent ...
متن کاملPositions 13 and 914 in Escherichia coli 16S ribosomal RNA are involved in the control of translational accuracy.
Using a conditional expression system with the temperature-inducible lambda PL promoter, we previously showed that the single mutations 13U-->A and 914A-->U, and the double mutation 13U-->A and 914A-->U in Escherichia coli 16S ribosomal RNA impair the binding of streptomycin (Pinard et al., The FASEB Journal, 1993, 7, 173-176). In this study, we found that the two single mutations and the doubl...
متن کاملذخیره در منابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید
ثبت ناماگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید
ورودعنوان ژورنال:
- Nucleic acids research
دوره 24 1 شماره
صفحات -
تاریخ انتشار 1994